More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3055 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  350  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  98.22 
 
 		 193 aa  342  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  87.57 
 
 		 169 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  85.45 
 
 		 169 aa  275  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.79 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.04 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  43.48 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  43.48 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  43.48 
 
 		 204 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  42.31 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.67 
 
 		 191 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  45.22 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  48 
 
 		 204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.58 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.25 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.48 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  43.48 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  41.4 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.88 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 393 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.67 
 
 		 190 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.16 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 		 311 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.49 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  40.49 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  40.25 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  39.88 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.71 
 
 		 404 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.27 
 
 		 327 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  38.99 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  39.1 
 
 		 408 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  38.96 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  38.36 
 
 		 306 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.27 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  40.88 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  37.11 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.08 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  38.46 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  37.34 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 311 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  36.6 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.12 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.12 
 
 		 330 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 304 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  36.6 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  37.97 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.25 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 		 311 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.03 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  34.59 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  34.34 
 
 		 309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  34.97 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 		 192 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  32.93 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.31 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  35.9 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>