More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4109 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  53.49 
 
 
178 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.14 
 
 
163 aa  167  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.92 
 
 
183 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  59.09 
 
 
173 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.9 
 
 
179 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  52.05 
 
 
179 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.68 
 
 
155 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  49.64 
 
 
430 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.52 
 
 
170 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  47.37 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.44 
 
 
166 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
170 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.32 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  32.72 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.68 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.59 
 
 
165 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  44.17 
 
 
162 aa  111  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
156 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  43.29 
 
 
181 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.16 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5758  flavin reductase domain-containing protein  42.21 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  43.21 
 
 
181 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 
170 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.61 
 
 
179 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.41 
 
 
190 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.45 
 
 
135 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.74 
 
 
177 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  39.43 
 
 
182 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.1 
 
 
180 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  48.09 
 
 
172 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  44.16 
 
 
181 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.21 
 
 
170 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
175 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
191 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  45.7 
 
 
166 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
191 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.77 
 
 
176 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  45.78 
 
 
484 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  39.24 
 
 
158 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40.76 
 
 
408 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.05 
 
 
169 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  44.87 
 
 
212 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
393 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
322 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.24 
 
 
330 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38.71 
 
 
204 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4453  putative flavin-dependent reductase  36.84 
 
 
193 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 
168 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  38.65 
 
 
163 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  40.65 
 
 
177 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  36.84 
 
 
166 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
175 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  41.48 
 
 
311 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.33 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  34.76 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  37.91 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
311 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  40.25 
 
 
169 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  38.32 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
173 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.41 
 
 
165 aa  99  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  35.4 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.59 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.77 
 
 
157 aa  98.2  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.8 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.18 
 
 
171 aa  97.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  37.18 
 
 
180 aa  97.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  42.04 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
193 aa  97.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  38.32 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.75 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  40.59 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  38.79 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  37.43 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  38.79 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  39.62 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.13 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  34.15 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  39.77 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
327 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>