More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4081 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
163 aa  329  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.14 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.75 
 
 
179 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.31 
 
 
183 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  54.73 
 
 
178 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  55.13 
 
 
179 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  54.25 
 
 
173 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.77 
 
 
171 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  43.79 
 
 
179 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  43.59 
 
 
430 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  41.77 
 
 
170 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  45.45 
 
 
311 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.65 
 
 
177 aa  117  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.38 
 
 
155 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  44.06 
 
 
306 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  45.14 
 
 
309 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  43.67 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  44.81 
 
 
177 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  41.18 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.14 
 
 
165 aa  111  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  42.31 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  43.4 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.06 
 
 
188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  43.36 
 
 
226 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  42.48 
 
 
170 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  46.26 
 
 
166 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.96 
 
 
311 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  32.28 
 
 
163 aa  106  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 
180 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.26 
 
 
311 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  40.82 
 
 
180 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
156 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.89 
 
 
165 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
172 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  37.58 
 
 
187 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  42.11 
 
 
168 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
169 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
186 aa  103  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 
181 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.84 
 
 
190 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  42.66 
 
 
226 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  42.96 
 
 
313 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
166 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  42.66 
 
 
226 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  41.29 
 
 
186 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.38 
 
 
330 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.94 
 
 
170 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 
175 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.8 
 
 
135 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.74 
 
 
155 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.85 
 
 
178 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  40.94 
 
 
393 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  38.27 
 
 
204 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  43.42 
 
 
178 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
173 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
188 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.56 
 
 
174 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  34.73 
 
 
169 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  39.75 
 
 
169 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.87 
 
 
186 aa  101  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 
169 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
175 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  39.75 
 
 
169 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 
169 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.49 
 
 
192 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1819  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.31 
 
 
194 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
193 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  41.01 
 
 
163 aa  100  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
169 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.36 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  39.13 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  39.75 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.26 
 
 
172 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
161 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
172 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  40.26 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.79 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.91 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.04 
 
 
190 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  42.28 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  40.37 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.88 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.89 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.06 
 
 
311 aa  98.6  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  38.04 
 
 
186 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.18 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  43.71 
 
 
212 aa  98.6  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
188 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>