More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1916 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  80.37 
 
 
166 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  80.37 
 
 
166 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  60.62 
 
 
177 aa  187  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  56.77 
 
 
172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  52.73 
 
 
181 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 
322 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  54.67 
 
 
175 aa  140  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 
174 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  49.02 
 
 
167 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  46.67 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  45.45 
 
 
313 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.28 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  50.64 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  51.28 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  48.03 
 
 
408 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  48.41 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  44 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  48.41 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  48.41 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  48.41 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.05 
 
 
309 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  46.91 
 
 
191 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  47.13 
 
 
169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  46.41 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  46.98 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  46.3 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1491  flavin reductase-like, FMN-binding  47.5 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177279  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.91 
 
 
192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  44.91 
 
 
204 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.91 
 
 
192 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  48.08 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 
180 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  51.92 
 
 
173 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.95 
 
 
169 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  43.95 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  43.9 
 
 
186 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
170 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.02 
 
 
166 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  40.76 
 
 
183 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  44.97 
 
 
172 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  44.97 
 
 
172 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  43.48 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.65 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 
174 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  48.7 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  48.7 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  48.7 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  43.71 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.23 
 
 
171 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  46.01 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  47.73 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  42.28 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.23 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  47.73 
 
 
311 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  50.33 
 
 
172 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  44.74 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  46.31 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  44.87 
 
 
186 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
188 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  46.45 
 
 
175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.9 
 
 
311 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.83 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  34.69 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.59 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
188 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  38.16 
 
 
187 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  44.37 
 
 
393 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.4 
 
 
190 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
182 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.22 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  36.36 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  43.24 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38.67 
 
 
186 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.1 
 
 
190 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  42.67 
 
 
171 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  43.05 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.65 
 
 
174 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.76 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.36 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 
173 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>