More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2607 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  328  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  80.37 
 
 		 166 aa  246  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  55.03 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  56.33 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  53.8 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  47.17 
 
 		 322 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  49.68 
 
 		 313 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  46.79 
 
 		 180 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  48.08 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  49.67 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  49.34 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  48.75 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 304 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  47.13 
 
 		 309 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  47.77 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.33 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1491  flavin reductase-like, FMN-binding  49.69 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  47.83 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  49.03 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  48.7 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  51.95 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  46.3 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  46.3 
 
 		 169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  49.35 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  45.73 
 
 		 191 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  44.44 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  43.71 
 
 		 204 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.17 
 
 		 192 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  43.59 
 
 		 172 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  44.72 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.75 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  42.77 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.54 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  42.26 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  48.55 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  38.36 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 188 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.74 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  42.95 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  46.45 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 		 408 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  36.2 
 
 		 188 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  46.94 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.26 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  42.94 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  42.21 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.71 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  36.48 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  43.05 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.83 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  44.37 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  44.37 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  44.37 
 
 		 175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  45.59 
 
 		 311 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  43.51 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  45.03 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.41 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  39.22 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  44.74 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.65 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.1 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.33 
 
 		 330 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  41.5 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.68 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  42.24 
 
 		 393 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  40.37 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.67 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.4 
 
 		 311 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.21 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 393 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 		 302 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  37.25 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.51 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  43.42 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 		 327 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>