More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1858 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 393 aa  798    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.32 
 
 		 259 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  60.14 
 
 		 170 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  48.3 
 
 		 156 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  47.62 
 
 		 156 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  54.67 
 
 		 176 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.04 
 
 		 160 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.51 
 
 		 171 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.33 
 
 		 155 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 		 158 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 		 172 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.89 
 
 		 179 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 188 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 		 161 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  38.06 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  39.35 
 
 		 161 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.54 
 
 		 177 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.54 
 
 		 330 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.35 
 
 		 161 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.72 
 
 		 168 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  38.71 
 
 		 161 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.64 
 
 		 204 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 188 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  40.14 
 
 		 161 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 		 181 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 188 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 188 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.36 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 		 182 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.67 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 164 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  33.99 
 
 		 187 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  36.13 
 
 		 161 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 160 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.31 
 
 		 166 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  36.88 
 
 		 183 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  36.84 
 
 		 166 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.14 
 
 		 174 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 		 161 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 169 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 161 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.87 
 
 		 170 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  38.78 
 
 		 173 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  36.94 
 
 		 207 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  38.26 
 
 		 180 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  36.6 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  36.18 
 
 		 161 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  37.27 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.06 
 
 		 168 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  36.49 
 
 		 177 aa  103  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 170 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 		 165 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 		 174 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  40.14 
 
 		 168 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.62 
 
 		 190 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 186 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 		 174 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  26.86 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  38.1 
 
 		 170 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 169 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.18 
 
 		 178 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 		 165 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.24 
 
 		 180 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.75 
 
 		 168 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.1 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  36.71 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.6 
 
 		 160 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  37.41 
 
 		 175 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  37.41 
 
 		 191 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  37.41 
 
 		 191 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.85 
 
 		 160 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.53 
 
 		 311 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 193 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 		 182 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  37.09 
 
 		 168 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  36.42 
 
 		 313 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.1 
 
 		 191 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 		 186 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  35.33 
 
 		 186 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.02 
 
 		 183 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  38.71 
 
 		 172 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 176 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  35.86 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 186 aa  97.1  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  37.3 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.41 
 
 		 169 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.33 
 
 		 189 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 		 302 aa  96.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  38.1 
 
 		 172 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 196 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.33 
 
 		 183 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  32.05 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>