More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0934 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  66.67 
 
 
183 aa  256  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  65.75 
 
 
183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  44 
 
 
189 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  38.69 
 
 
173 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  39.39 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.24 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.38 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.24 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  42.24 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.93 
 
 
180 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  35.54 
 
 
175 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  37.72 
 
 
174 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
165 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  35.19 
 
 
178 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  35.8 
 
 
173 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  32.92 
 
 
162 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  33.93 
 
 
171 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.9 
 
 
179 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
393 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  37.66 
 
 
170 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  37.66 
 
 
170 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.85 
 
 
204 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.59 
 
 
179 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  38.69 
 
 
183 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  34.69 
 
 
166 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  32.08 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  34.55 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  35.54 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  31.58 
 
 
193 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
185 aa  99  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  32.53 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.61 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  37.91 
 
 
167 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  34.16 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  32.34 
 
 
171 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.67 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 
190 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 
154 aa  94.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.55 
 
 
176 aa  94.7  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  32.08 
 
 
164 aa  94.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  34.5 
 
 
170 aa  94.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
164 aa  94.4  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  38.27 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  31.97 
 
 
147 aa  92.8  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  34 
 
 
259 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.86 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  32.08 
 
 
174 aa  91.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  33.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.54 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  35.33 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  37.59 
 
 
149 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  33.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  38.51 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.92 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  34.38 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.45 
 
 
374 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 
156 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.97 
 
 
190 aa  88.2  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  34.42 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.21 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 
156 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  35.14 
 
 
202 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  34.57 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  29.63 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  34.94 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.67 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  36.13 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  34.57 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  36.69 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
167 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.94 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
170 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  36 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  36 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.74 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.33 
 
 
170 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.77 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  34.94 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>