More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1079 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
202 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  88.12 
 
 
202 aa  338  5e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  89.6 
 
 
201 aa  322  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.03 
 
 
172 aa  218  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  66.46 
 
 
172 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.78 
 
 
184 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.97 
 
 
180 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  55.29 
 
 
178 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  54.66 
 
 
180 aa  188  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  53.8 
 
 
175 aa  187  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  55.06 
 
 
164 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  55.06 
 
 
164 aa  185  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  51.9 
 
 
164 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  49.12 
 
 
176 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  50.97 
 
 
165 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  51.23 
 
 
176 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.3 
 
 
181 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.28 
 
 
181 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  46.01 
 
 
169 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  46.88 
 
 
171 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  46.26 
 
 
147 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.04 
 
 
175 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  49.04 
 
 
167 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  45.62 
 
 
171 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  47.74 
 
 
165 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  45.62 
 
 
170 aa  154  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.25 
 
 
204 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.32 
 
 
181 aa  147  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  46.25 
 
 
170 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  40.96 
 
 
169 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 
168 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  43.67 
 
 
170 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  44.09 
 
 
186 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  44.03 
 
 
193 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
193 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.22 
 
 
179 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  47.1 
 
 
180 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  42.35 
 
 
173 aa  141  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.06 
 
 
181 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  42.11 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  45.62 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  45.12 
 
 
181 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  42.94 
 
 
196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  43.64 
 
 
164 aa  137  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  44.44 
 
 
181 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  42.6 
 
 
183 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  44.51 
 
 
181 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  43.83 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  44.38 
 
 
169 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  46.41 
 
 
175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  43.9 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.77 
 
 
170 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  40.96 
 
 
186 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 
164 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  41.45 
 
 
171 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  43.75 
 
 
175 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  39.47 
 
 
165 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.47 
 
 
165 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  39.47 
 
 
165 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 
164 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  40.94 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.13 
 
 
170 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  40.13 
 
 
170 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.13 
 
 
170 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  40.13 
 
 
170 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.13 
 
 
170 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  39.6 
 
 
150 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 
165 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.79 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.79 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.79 
 
 
170 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.79 
 
 
170 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.79 
 
 
170 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.35 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  35.58 
 
 
174 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  39.62 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.58 
 
 
374 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  39.63 
 
 
171 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  36.3 
 
 
149 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
185 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 
162 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  39.49 
 
 
173 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7406  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase reductase component  37.66 
 
 
211 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  40.13 
 
 
172 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
162 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.28 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  35.54 
 
 
170 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  36.55 
 
 
226 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  35.1 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.8 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.47 
 
 
259 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>