More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5060 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 190 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  95.56 
 
 		 191 aa  343  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  50.91 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  48.17 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  52.98 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.57 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.35 
 
 		 179 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  43.83 
 
 		 173 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  48.12 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  41.1 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  36.65 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  44.97 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  36.97 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  35.98 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  38.71 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  42.42 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.16 
 
 		 374 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  35.9 
 
 		 161 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.1 
 
 		 164 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  34.52 
 
 		 177 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  37.14 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  34.97 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.78 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 161 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  31.48 
 
 		 161 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  33.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.48 
 
 		 161 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  33.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  33.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  33.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  36.88 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  33.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  32.52 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.64 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 161 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  33.57 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 		 161 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.24 
 
 		 164 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  32.05 
 
 		 161 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  35.14 
 
 		 172 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 		 161 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  34.48 
 
 		 164 aa  87.8  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  32.32 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  33.53 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.62 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  32.35 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 		 161 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.5 
 
 		 430 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  35.71 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  34.04 
 
 		 167 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  28.76 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  33.72 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35 
 
 		 171 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.43 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  36.99 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.99 
 
 		 172 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  32.24 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  31.41 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.69 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.16 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.92 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  30.52 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  35.1 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.1 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  29.61 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  31.08 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  31.29 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.12 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  32.45 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  35.77 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 		 172 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.28 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.78 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.8 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  33.95 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  33.73 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  34.75 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.57 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>