More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3295 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.51 
 
 
189 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  40.35 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  49.04 
 
 
165 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  41.18 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  39.18 
 
 
173 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  39.87 
 
 
173 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.97 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
191 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.13 
 
 
160 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.93 
 
 
179 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.59 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.17 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.57 
 
 
171 aa  95.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  32.45 
 
 
162 aa  95.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  31.52 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  35.15 
 
 
174 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  31.51 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.78 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.78 
 
 
172 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.89 
 
 
179 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  89  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
186 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
170 aa  88.6  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  34.01 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.82 
 
 
304 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.63 
 
 
190 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  30.91 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
309 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  37.68 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  30.67 
 
 
166 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.11 
 
 
162 aa  84.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
173 aa  84.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  31.11 
 
 
313 aa  84.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  27.56 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.36 
 
 
169 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.41 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  30 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  32.48 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  30.67 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  32.03 
 
 
170 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.59 
 
 
169 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.68 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.48 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  37.31 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  30.61 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  37.31 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  29.7 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.61 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  30.06 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  35 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  33.57 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28.04 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
228 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  27.87 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2949  flavin reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.87 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.14 
 
 
311 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  28.25 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  30.52 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  26.17 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 
228 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  29.81 
 
 
306 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.43 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  24.16 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>