More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1869 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  100 
 
 
165 aa  328  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.12 
 
 
189 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  50.32 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  53.96 
 
 
185 aa  157  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  49.04 
 
 
190 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  54.68 
 
 
182 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.66 
 
 
179 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  48.2 
 
 
173 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.98 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  48.3 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 
191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.97 
 
 
190 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  48.25 
 
 
186 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  44.83 
 
 
174 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  41.3 
 
 
166 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.13 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  37.86 
 
 
174 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.41 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.65 
 
 
184 aa  94  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.6 
 
 
374 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  36.67 
 
 
318 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  35.97 
 
 
162 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  35.17 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.1 
 
 
175 aa  91.7  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.19 
 
 
179 aa  90.9  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.53 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  36.69 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  37.4 
 
 
150 aa  89  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  39.26 
 
 
197 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  33.09 
 
 
176 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  34.13 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
186 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.17 
 
 
316 aa  87.8  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.37 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.13 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
172 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.5 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.75 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  40.8 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  31.87 
 
 
183 aa  85.1  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
304 aa  85.1  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  35.07 
 
 
320 aa  84.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.8 
 
 
393 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  39.29 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
161 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  36.51 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
164 aa  84.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  30.14 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  34.53 
 
 
166 aa  84  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.71 
 
 
181 aa  84  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.99 
 
 
183 aa  84  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.07 
 
 
190 aa  84  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  36.92 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.81 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  34.29 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.4 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.13 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  34.13 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.15 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  30.83 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  33.58 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  34.48 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  34.11 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.15 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  33.58 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  34.48 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.53 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  34.29 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.59 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
181 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  43.2 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  35.71 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.48 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.71 
 
 
430 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  33.59 
 
 
313 aa  81.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  33.58 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  34.56 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  32.33 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  39.82 
 
 
204 aa  80.9  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.03 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.21 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>