More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2880 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  51.34 
 
 		 193 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  53.12 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  46.51 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  49.33 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.57 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  51.57 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  48.08 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  43.95 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  44.59 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.51 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.26 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  48.73 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  44 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  39.61 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  41.61 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  37.18 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  37.75 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.96 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  39.61 
 
 		 174 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  38.96 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.28 
 
 		 374 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  36.24 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 408 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 304 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.48 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  38.78 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  37.42 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  36.13 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  33.33 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 170 aa  99  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  42.86 
 
 		 175 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.22 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  34.42 
 
 		 166 aa  97.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.31 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.01 
 
 		 165 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  39.47 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  35.8 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.78 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 393 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  37.78 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  35.06 
 
 		 313 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  33.95 
 
 		 175 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  33.92 
 
 		 309 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.33 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  35.03 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.67 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  34.44 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  32.45 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  33.33 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.36 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 226 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.21 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2949  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 		 178 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 164 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 226 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  32.12 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 226 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  33.33 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.67 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.41 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.87 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  34.23 
 
 		 147 aa  93.2  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.41 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.41 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  35.48 
 
 		 171 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  37.41 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 228 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  31.4 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  31.33 
 
 		 171 aa  92  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 226 aa  91.7  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.99 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  36 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.33 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 167 aa  91.3  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  36 
 
 		 165 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>