More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1462 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  57.79 
 
 
160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  60.9 
 
 
393 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  56.21 
 
 
162 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  57.79 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.55 
 
 
404 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  48.72 
 
 
207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.05 
 
 
162 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  46.71 
 
 
170 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 
165 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  45.34 
 
 
188 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  45.83 
 
 
187 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.37 
 
 
190 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.31 
 
 
190 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  45.91 
 
 
188 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  45.91 
 
 
188 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  45.91 
 
 
204 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
175 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 
168 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  46.99 
 
 
204 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.34 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.98 
 
 
171 aa  138  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.65 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  44.72 
 
 
188 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.76 
 
 
188 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  40.49 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  42.59 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  44 
 
 
191 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.48 
 
 
311 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  39.88 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  39.88 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  39.88 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  41.77 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  39.88 
 
 
169 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
175 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 
169 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.51 
 
 
178 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 
169 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  41.14 
 
 
169 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.48 
 
 
169 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
185 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 
185 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.75 
 
 
191 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  43.54 
 
 
179 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  43.79 
 
 
327 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  44.44 
 
 
172 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
172 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  38.99 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  36.81 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.5 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.4 
 
 
330 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.57 
 
 
408 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  39.87 
 
 
168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
160 aa  117  7e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  40.25 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 
309 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
226 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  42.95 
 
 
306 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  40.74 
 
 
313 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  37.34 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.24 
 
 
160 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  40.38 
 
 
175 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
322 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.36 
 
 
311 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.42 
 
 
169 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
304 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.12 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  40.65 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 
186 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  35.62 
 
 
161 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.97 
 
 
311 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
181 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  35.8 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  41.1 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.04 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  38.61 
 
 
166 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
311 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.97 
 
 
177 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  34.57 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  32.48 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  33.95 
 
 
161 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>