More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5504 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
330 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  65.22 
 
 
323 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  68.27 
 
 
346 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  63.98 
 
 
327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  44.38 
 
 
320 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.4 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  36.74 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  42.77 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
311 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.66 
 
 
311 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.49 
 
 
311 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  34.54 
 
 
302 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  52.98 
 
 
226 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  52.98 
 
 
226 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  52.98 
 
 
226 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  50.33 
 
 
304 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  47.4 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.91 
 
 
190 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  47.27 
 
 
175 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  49.67 
 
 
408 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
188 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  41.77 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  46.06 
 
 
175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.52 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  43.98 
 
 
322 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.83 
 
 
183 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  41.52 
 
 
188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  41.52 
 
 
188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  45.78 
 
 
175 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
188 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.14 
 
 
177 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.69 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  42.6 
 
 
187 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.12 
 
 
190 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  44.58 
 
 
175 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  44.58 
 
 
175 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  44.58 
 
 
175 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
169 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  42.24 
 
 
171 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 
171 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  45.91 
 
 
172 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  41.32 
 
 
174 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  45.91 
 
 
172 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.99 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
171 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
182 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  43.4 
 
 
172 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.16 
 
 
165 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  44.52 
 
 
177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 
170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  44.37 
 
 
186 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.76 
 
 
170 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  43.15 
 
 
169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  43.15 
 
 
169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  43.15 
 
 
169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
170 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 
180 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  42.48 
 
 
172 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.12 
 
 
188 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  40.76 
 
 
174 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.15 
 
 
169 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  41.56 
 
 
166 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  39.35 
 
 
162 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  38.12 
 
 
169 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.45 
 
 
168 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  40.12 
 
 
202 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  39.62 
 
 
169 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  42.03 
 
 
169 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  42.03 
 
 
169 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  40.62 
 
 
191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.56 
 
 
179 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.65 
 
 
169 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  46.45 
 
 
173 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  41.5 
 
 
172 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.47 
 
 
171 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  41.03 
 
 
161 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.61 
 
 
430 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  38.85 
 
 
169 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  41.5 
 
 
160 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
156 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  47.26 
 
 
172 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
193 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  41.18 
 
 
207 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  40.62 
 
 
168 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.1 
 
 
184 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.89 
 
 
169 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 
180 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 
170 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.72 
 
 
165 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  40.14 
 
 
172 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
178 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
168 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>