More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2494 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  95.86 
 
 
169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  95.27 
 
 
169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  95.27 
 
 
169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  95.27 
 
 
169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  91.12 
 
 
169 aa  322  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  81.87 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  81.07 
 
 
174 aa  286  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  81.29 
 
 
171 aa  284  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  78.11 
 
 
169 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  77.51 
 
 
169 aa  276  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  61.93 
 
 
186 aa  224  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  63.37 
 
 
204 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  64.12 
 
 
191 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.69 
 
 
192 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  62.94 
 
 
192 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  55.69 
 
 
168 aa  194  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.08 
 
 
169 aa  192  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  57.14 
 
 
172 aa  192  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  57.23 
 
 
173 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.63 
 
 
186 aa  191  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  53.85 
 
 
172 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  56.02 
 
 
186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  58.28 
 
 
170 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  54.17 
 
 
186 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  57.23 
 
 
173 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 
167 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  51.92 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  48.77 
 
 
322 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
175 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  47.2 
 
 
175 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  49.06 
 
 
175 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  49.06 
 
 
175 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  49.06 
 
 
175 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 
175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  49.07 
 
 
309 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  44.97 
 
 
313 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  49.11 
 
 
171 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.24 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  44.91 
 
 
168 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  44.1 
 
 
304 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  46.88 
 
 
166 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  47.13 
 
 
174 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.2 
 
 
311 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 
174 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  50.75 
 
 
180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  45 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 
186 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  45 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  40.59 
 
 
170 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  49.02 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  49.02 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  49.02 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  50.99 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 
180 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  39.26 
 
 
172 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.16 
 
 
165 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 
156 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
156 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  40.99 
 
 
183 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 
408 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.23 
 
 
172 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
181 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  40.37 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  47.26 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.98 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  44.44 
 
 
207 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 
393 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.12 
 
 
174 aa  117  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  41.84 
 
 
327 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  42.68 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  42.24 
 
 
161 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.03 
 
 
330 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  39.22 
 
 
163 aa  114  8.999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.51 
 
 
162 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  44.03 
 
 
177 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.89 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  42.77 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  41.35 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  45.68 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  46.41 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.03 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  41.35 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.26 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.35 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.4 
 
 
177 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 
302 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>