More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2668 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  90.81 
 
 
185 aa  317  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  52.11 
 
 
190 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.91 
 
 
190 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.42 
 
 
188 aa  174  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  49.7 
 
 
187 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.63 
 
 
162 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  167  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  50.62 
 
 
188 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  50.62 
 
 
204 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  50.62 
 
 
188 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  48.77 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.45 
 
 
170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  48.65 
 
 
179 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  51.63 
 
 
207 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.02 
 
 
171 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  50.66 
 
 
204 aa  148  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  44.64 
 
 
393 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  40.49 
 
 
169 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  47.37 
 
 
168 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  46.94 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  46.45 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  45.93 
 
 
191 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  44.03 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  42.33 
 
 
169 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.1 
 
 
165 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  40.49 
 
 
193 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  43.75 
 
 
162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 
169 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.92 
 
 
404 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  39.74 
 
 
306 aa  124  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  42.5 
 
 
327 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  40 
 
 
202 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  35.96 
 
 
311 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 
408 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.61 
 
 
330 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
311 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  38.31 
 
 
180 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.24 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.47 
 
 
155 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4001  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.371931  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 
311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 
311 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  40.4 
 
 
160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  37.34 
 
 
161 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
161 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
156 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  38.69 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
226 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 
180 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
172 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
304 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  38.69 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  37.97 
 
 
161 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 
183 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
226 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
226 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  37.75 
 
 
156 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 
311 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  35.19 
 
 
313 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  36.48 
 
 
171 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  38.27 
 
 
172 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  37.96 
 
 
161 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  36.84 
 
 
186 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  36.13 
 
 
166 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
167 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0279  flavin reductase domain-containing protein  35.1 
 
 
167 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.932981  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.71 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
161 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0399  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.312372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.39 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.51 
 
 
174 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.07 
 
 
174 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.8 
 
 
170 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
196 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.12 
 
 
161 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  35.61 
 
 
302 aa  98.6  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.59 
 
 
177 aa  98.2  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  40.85 
 
 
166 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10248  oxidoreductase  34.42 
 
 
162 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.712736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.16 
 
 
170 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  37.74 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  37.2 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2298  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.48 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  34.38 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4843  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  35.76 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.36 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  36.55 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  40.26 
 
 
318 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  33.92 
 
 
322 aa  95.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.27 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  36.65 
 
 
430 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>