More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3861 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  62.72 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  46.41 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.37 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  45.1 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.86 
 
 		 155 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  42.6 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 		 154 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 		 322 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  43.48 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  42.01 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  42.01 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  42.01 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.05 
 
 		 166 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 		 175 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  43.14 
 
 		 175 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  44.16 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.52 
 
 		 166 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 156 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 156 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 		 155 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.1 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  38.25 
 
 		 313 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 174 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.49 
 
 		 168 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  43.29 
 
 		 179 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1723  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.88 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  39.29 
 
 		 169 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  36.65 
 
 		 161 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  41.56 
 
 		 170 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.12 
 
 		 430 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.14 
 
 		 172 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  32.7 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  40.13 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  44.17 
 
 		 173 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  38.06 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.27 
 
 		 327 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 304 aa  92.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  39.88 
 
 		 168 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 		 173 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  35.98 
 
 		 158 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 160 aa  92.4  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.66 
 
 		 177 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  41.83 
 
 		 174 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  38.69 
 
 		 169 aa  91.7  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.9 
 
 		 311 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  39.13 
 
 		 169 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.16 
 
 		 160 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  41.03 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  38.1 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  36.13 
 
 		 166 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 		 408 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.81 
 
 		 180 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  37.42 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 178 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.71 
 
 		 169 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  39.61 
 
 		 177 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  36.59 
 
 		 180 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  45.11 
 
 		 172 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.04 
 
 		 186 aa  88.2  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.95 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.56 
 
 		 330 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  38.71 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 311 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.77 
 
 		 484 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  41.22 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.65 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  38.55 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  35.12 
 
 		 306 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.74 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 164 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>