More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0553 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
173 aa  344  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.49 
 
 
183 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  60 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.09 
 
 
174 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  61.15 
 
 
179 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.32 
 
 
179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.25 
 
 
163 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.77 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  40.99 
 
 
313 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  44.17 
 
 
214 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.37 
 
 
170 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  42.24 
 
 
309 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  41.98 
 
 
180 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  39.41 
 
 
181 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.38 
 
 
155 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  48.46 
 
 
172 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.11 
 
 
177 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  40.74 
 
 
180 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  39.88 
 
 
181 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  45.71 
 
 
311 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.41 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  41.51 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  42.65 
 
 
304 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.78 
 
 
190 aa  99  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  40.36 
 
 
193 aa  99  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.51 
 
 
430 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.38 
 
 
163 aa  97.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  40.77 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.68 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  37.5 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.65 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
302 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  40.99 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.94 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  41.54 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  37.2 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  36.97 
 
 
204 aa  95.5  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.3 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  37.27 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
161 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  41.36 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  43.12 
 
 
212 aa  94.4  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  37.97 
 
 
177 aa  94  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.29 
 
 
484 aa  93.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.65 
 
 
311 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.76 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.3 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.24 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  45.52 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  40.36 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  40.36 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  45.52 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  42.34 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  45.52 
 
 
178 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  40.12 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  39.51 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  37.79 
 
 
175 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  39.74 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1819  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.58 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.88 
 
 
184 aa  91.3  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.86 
 
 
330 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  43.12 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
322 aa  90.9  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 
186 aa  90.5  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.13 
 
 
306 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  39.02 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  40.62 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  39.13 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.21 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.68 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.84 
 
 
311 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.48 
 
 
311 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.73 
 
 
170 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 
169 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
169 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
169 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.35 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.1 
 
 
192 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  33.33 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  31.36 
 
 
188 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.31 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
320 aa  87.8  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.74 
 
 
166 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  39.38 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  39.64 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  38.64 
 
 
161 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.85 
 
 
172 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
172 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>