More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0693 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  356  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.69 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
178 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 
183 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.56 
 
 
177 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.31 
 
 
179 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  33.73 
 
 
161 aa  97.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.36 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.76 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  35.58 
 
 
170 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  37.58 
 
 
313 aa  95.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.93 
 
 
311 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  38.41 
 
 
160 aa  94  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  34.57 
 
 
187 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.14 
 
 
311 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  36.31 
 
 
188 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.48 
 
 
174 aa  90.9  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
204 aa  90.9  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.95 
 
 
190 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  36.2 
 
 
171 aa  88.6  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
311 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.4 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
304 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  38.12 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  34.97 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  37.13 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.99 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  36.31 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
330 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.97 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.77 
 
 
191 aa  84.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.33 
 
 
204 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  37.5 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  36.77 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2865  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  31.41 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180044  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  33.74 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.55 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  36.14 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  33.74 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  33.74 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.42 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  31.58 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  31.68 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  36.2 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  39.74 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0990  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.55 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  32.47 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  31.55 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  31.95 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
404 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.91 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  34.04 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  35.26 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  33.09 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3609  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.84 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0867799  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  30.82 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.96 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  31.71 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2676  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.62 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  33.72 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
346 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  32.7 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  32.35 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  36.43 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  32.35 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  32.3 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>