More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0578 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  100 
 
 		 163 aa  321  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0401  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  56.49 
 
 		 162 aa  173  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8176  nitrilotriacetate monooxygenase  55.35 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2865  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  53.21 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3609  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  59.15 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0867799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.1 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.65 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.77 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  36.54 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  37.2 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.94 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.34 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.8 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.06 
 
 		 190 aa  88.2  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.03 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.4 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.84 
 
 		 182 aa  85.1  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.37 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 204 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 169 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 304 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.58 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.08 
 
 		 190 aa  84  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.13 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3051  flavin reductase domain-containing protein  40.31 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.94 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  41.09 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.98 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.01 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  39.71 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  38.81 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  32.05 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.39 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.55 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  36.71 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.59 
 
 		 484 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.35 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.12 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  33.94 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.76 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  35.42 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  37.01 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  38.17 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  30.19 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  35.42 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.74 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.1 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  33.74 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 393 aa  77.8  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.38 
 
 		 204 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  36.23 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.91 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 173 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  36.57 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  36.96 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.4 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.66 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2676  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.07 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  34.52 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.28 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  35.93 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.86 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  39.42 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  36.76 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.59 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.3 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.04 
 
 		 430 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  37.59 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.54 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  35.66 
 
 		 311 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  38.35 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.4 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  33.54 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.64 
 
 		 311 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  34.13 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.85 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>