More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0401 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0401  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
162 aa  316  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  56.49 
 
 
163 aa  173  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8176  nitrilotriacetate monooxygenase  47.06 
 
 
159 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3609  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.65 
 
 
142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0867799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.72 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2865  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  44.52 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180044  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  33.76 
 
 
172 aa  84.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.33 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.26 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
177 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.34 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.93 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.85 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.5 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.38 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  32.08 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.09 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  30.82 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.95 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  38 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  37.3 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3629  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.46 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1186  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.85 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.81 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.69 
 
 
190 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  31.68 
 
 
322 aa  67  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.33 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  30.71 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  33.55 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  34.33 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  31.87 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  30.92 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  29.19 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  31.48 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.58 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  33.58 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  31.58 
 
 
311 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  33.78 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  33.57 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.17 
 
 
484 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.82 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  30.88 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.99 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  32.35 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3051  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  32.92 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.85 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 
311 aa  63.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.56 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.96 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  34.21 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.94 
 
 
259 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.59 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  31.65 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  32.24 
 
 
311 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  26.97 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  30.66 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  30.32 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  31.58 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.86 
 
 
192 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  29.5 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  32.41 
 
 
346 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  33.78 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  31.94 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  28.57 
 
 
193 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.56 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  32.12 
 
 
306 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  33.56 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.63 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  40.24 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  40.24 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.3 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>