More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6349 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.92 
 
 
174 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  59.49 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  51.23 
 
 
178 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.31 
 
 
163 aa  150  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.08 
 
 
179 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  49.4 
 
 
179 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.15 
 
 
165 aa  138  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.83 
 
 
330 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  43.68 
 
 
327 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.25 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.12 
 
 
179 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.88 
 
 
155 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  48.91 
 
 
306 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.88 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.72 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.02 
 
 
430 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  43.12 
 
 
408 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.72 
 
 
311 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.24 
 
 
171 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  45.26 
 
 
311 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  43.7 
 
 
323 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  44.93 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.15 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  45.65 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  45.65 
 
 
226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.99 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  45.19 
 
 
346 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.24 
 
 
190 aa  111  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  40.88 
 
 
304 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.94 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  42.21 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  33.33 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  41.51 
 
 
313 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  38.04 
 
 
168 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  33.91 
 
 
188 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  41.03 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  39.43 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.57 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.73 
 
 
175 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  39.16 
 
 
172 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  39.16 
 
 
172 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 
158 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
171 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
174 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.73 
 
 
175 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  44.3 
 
 
212 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.2 
 
 
207 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.73 
 
 
175 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
175 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40.36 
 
 
175 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
174 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
170 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  38.12 
 
 
160 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  44.9 
 
 
166 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
204 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.71 
 
 
170 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  37.08 
 
 
181 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  39.53 
 
 
170 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 
175 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
171 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 
309 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  41.72 
 
 
162 aa  104  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
188 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  38.93 
 
 
166 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.76 
 
 
204 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  32.76 
 
 
188 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
181 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
322 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
172 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
175 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.97 
 
 
168 aa  101  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.67 
 
 
160 aa  101  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  42.01 
 
 
178 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
172 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  38.36 
 
 
180 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0578  putative reductase  38.22 
 
 
163 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.637649  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  37.74 
 
 
161 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.62 
 
 
180 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5120  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 
163 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 
172 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
169 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.36 
 
 
166 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 
174 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.18 
 
 
169 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.24 
 
 
155 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
156 aa  99  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>