More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2409 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  93.37 
 
 		 181 aa  346  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.62 
 
 		 166 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  55.65 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  49.66 
 
 		 162 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1723  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.73 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.74 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 156 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  46 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  45.1 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  42.17 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 393 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.21 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  42.21 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2513  putative PAH-inducible ring hydroxylating monooxygenase small subunit  49.19 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0458261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.08 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4507  flavin reductase-like, FMN-binding  39.86 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.657354  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  38.61 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.72 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.24 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 160 aa  102  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.84 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.01 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.24 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  38.93 
 
 		 154 aa  101  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.58 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  38.99 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.88 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.54 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  42.47 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.4 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.88 
 
 		 204 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.16 
 
 		 157 aa  98.2  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  42.24 
 
 		 173 aa  97.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.5 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.27 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.38 
 
 		 430 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  39.07 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.69 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 		 304 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  38.79 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 302 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.06 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.48 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 237 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  38.79 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  38.79 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.65 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 322 aa  95.5  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 169 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  34.76 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  39.31 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  39.31 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.73 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  39.31 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.6 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  38.96 
 
 		 202 aa  94.4  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 		 169 aa  94.4  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.47 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.26 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.18 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4436  hypothetical protein  42.22 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 408 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  40.7 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  37.74 
 
 		 313 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  36.81 
 
 		 166 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.56 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.75 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  37.18 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  37.58 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  38.04 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  41.55 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 309 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.61 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  38.26 
 
 		 174 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  40.3 
 
 		 311 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 		 182 aa  91.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>