More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3558 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.77 
 
 
183 aa  131  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 
311 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.38 
 
 
172 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.06 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.49 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.59 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.02 
 
 
177 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.34 
 
 
430 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.35 
 
 
171 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.25 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.41 
 
 
190 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 
330 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 
165 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.54 
 
 
161 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  40.27 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 
161 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  36.26 
 
 
186 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
182 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  36.71 
 
 
202 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  41.25 
 
 
175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
156 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  41.25 
 
 
175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  41.25 
 
 
175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
172 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  37.58 
 
 
172 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 
166 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  41.06 
 
 
393 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
161 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.97 
 
 
190 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  37.28 
 
 
180 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.89 
 
 
155 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  35.8 
 
 
313 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  36.31 
 
 
161 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
304 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.52 
 
 
162 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
161 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
171 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 
161 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 
170 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
393 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.42 
 
 
168 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.47 
 
 
174 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.07 
 
 
174 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.9 
 
 
161 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  37.28 
 
 
180 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
161 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
181 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.07 
 
 
155 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
181 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
175 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.67 
 
 
188 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.42 
 
 
170 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.21 
 
 
327 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
171 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  43.42 
 
 
193 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  38.46 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  35.1 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  38.96 
 
 
408 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.8 
 
 
175 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
309 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
169 aa  99  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.73 
 
 
259 aa  98.6  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  32.69 
 
 
161 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  36.99 
 
 
193 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  35.26 
 
 
161 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.42 
 
 
159 aa  97.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  34.52 
 
 
187 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  37.97 
 
 
169 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.76 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.94 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 
166 aa  97.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  37.34 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
169 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  36.67 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.62 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  34.52 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  33.92 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.65 
 
 
186 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  36.71 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.93 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>