More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0576 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  65.19 
 
 
190 aa  240  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  59.55 
 
 
188 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  59.22 
 
 
204 aa  204  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  59.22 
 
 
188 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  59.22 
 
 
188 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  58.1 
 
 
188 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  56.22 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  52.91 
 
 
190 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  49.42 
 
 
185 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  49.01 
 
 
171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  48.67 
 
 
393 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  48.84 
 
 
185 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  45.58 
 
 
179 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.91 
 
 
162 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  42.04 
 
 
306 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  46.78 
 
 
204 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  46.71 
 
 
207 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.98 
 
 
170 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.56 
 
 
404 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.76 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.86 
 
 
191 aa  131  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 
311 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.38 
 
 
170 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
226 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 
311 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.21 
 
 
165 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  42.04 
 
 
162 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.52 
 
 
172 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.52 
 
 
172 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 
193 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
226 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 
226 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 
311 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  38.71 
 
 
161 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42 
 
 
191 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  38.75 
 
 
311 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
161 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
161 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.12 
 
 
330 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  37.97 
 
 
408 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  40.4 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  38.71 
 
 
180 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  40.14 
 
 
160 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.87 
 
 
327 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
304 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
302 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
182 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  41.06 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  38.06 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  39.71 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 
161 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
309 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  37.99 
 
 
318 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
175 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  35.5 
 
 
313 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  37.67 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.97 
 
 
162 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 
320 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.04 
 
 
192 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  39.19 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.04 
 
 
192 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
171 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
161 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
322 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  36.99 
 
 
161 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
169 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  37.65 
 
 
169 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
178 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
169 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 
169 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  37.04 
 
 
169 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.39 
 
 
169 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 
158 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.16 
 
 
155 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.76 
 
 
161 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 
170 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
171 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  36.84 
 
 
161 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
169 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>