More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2083 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  97.52 
 
 
161 aa  322  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  97.52 
 
 
161 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  96.89 
 
 
161 aa  320  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  92.55 
 
 
161 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  88.75 
 
 
161 aa  299  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  85.62 
 
 
161 aa  292  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  84.81 
 
 
161 aa  288  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  75.32 
 
 
161 aa  253  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  73.89 
 
 
161 aa  250  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  70.89 
 
 
161 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  70.89 
 
 
161 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  70.89 
 
 
161 aa  243  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  70.89 
 
 
161 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.64 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.03 
 
 
170 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.68 
 
 
171 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.29 
 
 
190 aa  120  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
169 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.25 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.67 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  35.62 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.59 
 
 
204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.13 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 
193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.61 
 
 
165 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 
408 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 
167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  37.91 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
170 aa  111  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
393 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.47 
 
 
311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.78 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
186 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.36 
 
 
188 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
170 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.61 
 
 
174 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
204 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
309 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  35.4 
 
 
304 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
169 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  36.6 
 
 
430 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
172 aa  103  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.19 
 
 
191 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.31 
 
 
174 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.74 
 
 
170 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  36.3 
 
 
306 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 
173 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  37.66 
 
 
172 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  35.26 
 
 
169 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 
404 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
169 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
169 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  36.88 
 
 
204 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.85 
 
 
169 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  34.78 
 
 
191 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
169 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.75 
 
 
192 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  34.62 
 
 
169 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
169 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 
156 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  35.26 
 
 
169 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
162 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.67 
 
 
207 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 
184 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  35.11 
 
 
302 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.27 
 
 
171 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.33 
 
 
311 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  35.44 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  35.44 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  32.72 
 
 
327 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  33.54 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  37.58 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  32.3 
 
 
186 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
196 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  32.88 
 
 
186 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  39.06 
 
 
311 aa  97.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>