More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3440 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  88.75 
 
 		 161 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  88.75 
 
 		 161 aa  300  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  88.75 
 
 		 161 aa  299  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  89.38 
 
 		 161 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  88.12 
 
 		 161 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  85 
 
 		 161 aa  290  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  85.62 
 
 		 161 aa  287  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  78.26 
 
 		 161 aa  267  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  74.53 
 
 		 161 aa  261  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  73.29 
 
 		 161 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  72.05 
 
 		 161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  70.81 
 
 		 161 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  70.19 
 
 		 161 aa  247  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.97 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.41 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.25 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  37.25 
 
 		 204 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  37.25 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 		 190 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  39.46 
 
 		 408 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  36.6 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  36.6 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.36 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 393 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  37.25 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.03 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 393 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 		 160 aa  111  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  37.25 
 
 		 169 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.11 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  35.22 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  35.81 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.26 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.47 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  34.46 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  44.08 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.67 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  36.6 
 
 		 430 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.48 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 		 404 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  34.21 
 
 		 306 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2722  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.27 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0043012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.33 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  36.6 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.21 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 302 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.85 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.05 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  34.93 
 
 		 309 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 		 180 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 304 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.29 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 311 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4101  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  38.06 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.55 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  32.3 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  37.09 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  37.09 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  33.33 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  33.99 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.64 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  36.18 
 
 		 174 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  33.33 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.53 
 
 		 179 aa  97.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  35.14 
 
 		 172 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 		 175 aa  97.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  33.12 
 
 		 191 aa  97.4  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  33.56 
 
 		 186 aa  97.1  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>