More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5077 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  57.79 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  48.08 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  48.34 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.05 
 
 		 171 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  49.69 
 
 		 393 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.95 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  45.16 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  46.71 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 		 169 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 		 175 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.2 
 
 		 404 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  45.34 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.65 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.05 
 
 		 162 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  43.79 
 
 		 169 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  42.31 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.61 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.23 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.62 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.24 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  42.17 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  46.41 
 
 		 174 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.07 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  40.52 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.26 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  41.14 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  42.41 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.75 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.4 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.25 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.12 
 
 		 330 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.56 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.33 
 
 		 155 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  41.06 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 		 408 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  41.61 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 		 311 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 		 327 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  38.61 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  38.22 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.72 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.41 
 
 		 311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  40.56 
 
 		 311 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  34.39 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.16 
 
 		 192 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  41.56 
 
 		 318 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.65 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.76 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  35.67 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  37.28 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.09 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  43.18 
 
 		 306 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  37.82 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.51 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 304 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  37.91 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.55 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  33.12 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  42.21 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.58 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.86 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  42.21 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  40.48 
 
 		 346 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.71 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.95 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.99 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  32.73 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>