More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2755 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  61.11 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  53.8 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  53.8 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  48.19 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  43.41 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1491  flavin reductase-like, FMN-binding  45.68 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 309 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  42.14 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  44.37 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  40.76 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.53 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  49.23 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.52 
 
 		 330 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  43.24 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.51 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.16 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  41.96 
 
 		 170 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  40.13 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.33 
 
 		 311 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  42.28 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.22 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  43.05 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  39.04 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.07 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  43.07 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  43.07 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  43.07 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  46.92 
 
 		 306 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  39.77 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  37.95 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  45.03 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.21 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.21 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  41.29 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 		 327 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.38 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.04 
 
 		 311 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  38.86 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  42.75 
 
 		 302 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  37.79 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.58 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  45.38 
 
 		 311 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.03 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  41.67 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  44.9 
 
 		 408 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 		 226 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 		 226 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  37.28 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40.24 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  38.67 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  41.25 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  40.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.13 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.13 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.62 
 
 		 311 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  41.22 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  45.04 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  39.1 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.76 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.76 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  38.55 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  36.91 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 204 aa  104  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  40.27 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  35.37 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  40.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  42.07 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.67 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  34.67 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>