More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4106 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  70.3 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  69.57 
 
 		 172 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  69.38 
 
 		 169 aa  230  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.45 
 
 		 186 aa  227  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  64.85 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  67.08 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  66.46 
 
 		 186 aa  221  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  65.62 
 
 		 173 aa  217  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  67.5 
 
 		 173 aa  206  9e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  61.69 
 
 		 167 aa  203  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  56.44 
 
 		 169 aa  190  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  57.14 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  57.67 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  57.67 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  58.28 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  57.67 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  58.28 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  57.67 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.7 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  57.67 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  56.96 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  53.11 
 
 		 186 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  55.7 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  52.98 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.23 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.6 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  52.83 
 
 		 322 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  53.94 
 
 		 191 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  51.23 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  52.38 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  48.26 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  51.02 
 
 		 174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  50.32 
 
 		 175 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  49.03 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  47.4 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  48 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  46.88 
 
 		 304 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  48.39 
 
 		 175 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  49.03 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  48.7 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  50.33 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  50.33 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  50.33 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 309 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  47.5 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  47.5 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  44.59 
 
 		 313 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  46.5 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  45.64 
 
 		 408 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  45.75 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.1 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  43.54 
 
 		 186 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  44.67 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  45.75 
 
 		 191 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  45.75 
 
 		 191 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  49.66 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  45.28 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.73 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.7 
 
 		 311 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.38 
 
 		 311 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.02 
 
 		 311 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  44.85 
 
 		 311 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  48.98 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 		 311 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.38 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  43.31 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  38.51 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  44.85 
 
 		 226 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.19 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  44.85 
 
 		 226 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  44.12 
 
 		 226 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  46.94 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  43.79 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 302 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  40.4 
 
 		 306 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.06 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  47.83 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  47.83 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  45.33 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 393 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  43.05 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  41.03 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  45.74 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  43.05 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.52 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  37.01 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>