More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1836 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  49.08 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  48.03 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.04 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  48.78 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  48.72 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  48.72 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  47.47 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  48.08 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  48.08 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  48.08 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  49.33 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  46.84 
 
 		 173 aa  134  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.51 
 
 		 311 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.95 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  44.94 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  45.28 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.94 
 
 		 186 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  44.52 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  41.61 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  40.35 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  41.61 
 
 		 169 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  43.67 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  40.99 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  40.99 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  40.99 
 
 		 169 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.88 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.18 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  39.13 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.76 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  36.77 
 
 		 322 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  39.38 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  39.75 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  41.89 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  38.24 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.39 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  38.16 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  40.4 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.97 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38.78 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.43 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  43.42 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  39.47 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 309 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 		 304 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  33.56 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.76 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 327 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  34.57 
 
 		 313 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 302 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  37.91 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  36.91 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 		 330 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  38.93 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.63 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.63 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.18 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  37.18 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  39.49 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 		 311 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  37.74 
 
 		 161 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  38.06 
 
 		 306 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  38.65 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.12 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.67 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.4 
 
 		 171 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  35.33 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  32.96 
 
 		 191 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.06 
 
 		 311 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  32.96 
 
 		 191 aa  95.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 		 393 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  39.22 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  34.59 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>