More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0763 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  85.94 
 
 
192 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  85.94 
 
 
192 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  71.28 
 
 
204 aa  275  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  69.61 
 
 
186 aa  265  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  66.67 
 
 
174 aa  227  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  64.33 
 
 
169 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.67 
 
 
169 aa  222  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  65.29 
 
 
169 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  65.29 
 
 
169 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  65.29 
 
 
169 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  65.29 
 
 
169 aa  220  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  63.74 
 
 
169 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  218  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  64.12 
 
 
169 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  64.12 
 
 
169 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  66.47 
 
 
171 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  56.21 
 
 
168 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.8 
 
 
169 aa  180  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  54.44 
 
 
186 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.44 
 
 
186 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  55.88 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  53.94 
 
 
170 aa  168  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  55.17 
 
 
173 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  51.72 
 
 
186 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  51.48 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  55.56 
 
 
167 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  53.85 
 
 
173 aa  154  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  50.31 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  46.91 
 
 
309 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  43.83 
 
 
313 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  46.01 
 
 
172 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  47.83 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.18 
 
 
166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  43.37 
 
 
322 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
304 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  46.15 
 
 
166 aa  131  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  46.01 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  46.01 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  46.01 
 
 
175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  46.67 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  45.45 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  44.85 
 
 
175 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.98 
 
 
172 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 
172 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.14 
 
 
162 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  43.12 
 
 
174 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  41.81 
 
 
180 aa  121  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  46.36 
 
 
166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  42.94 
 
 
180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  50.79 
 
 
172 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  40.37 
 
 
327 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.27 
 
 
172 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  37.97 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.35 
 
 
179 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.76 
 
 
170 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  43.04 
 
 
172 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.62 
 
 
330 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.92 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.14 
 
 
408 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  42.94 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  38.33 
 
 
186 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.01 
 
 
165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  44.2 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  40.48 
 
 
393 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.13 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.41 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  41.03 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.12 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  37.82 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  45.73 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  45.73 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  36.25 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.72 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  36.69 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.59 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  38.86 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
181 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
156 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.36 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  43.66 
 
 
311 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
193 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
188 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  35.84 
 
 
188 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  38.99 
 
 
162 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1695  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
166 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.84 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.2 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  41.67 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  41.67 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  40.26 
 
 
311 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>