More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3504 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  62.46 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  52.88 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  60 
 
 		 172 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  60 
 
 		 172 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  34.08 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  47.54 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  52.98 
 
 		 174 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  49.07 
 
 		 175 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  48.47 
 
 		 175 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  46.39 
 
 		 175 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  46.39 
 
 		 175 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.56 
 
 		 166 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  46.63 
 
 		 175 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  47.2 
 
 		 175 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  47.2 
 
 		 175 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  48.12 
 
 		 166 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.36 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  50.96 
 
 		 172 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  47.44 
 
 		 226 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  47.44 
 
 		 226 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  47.44 
 
 		 226 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  49.07 
 
 		 169 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  49.07 
 
 		 169 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  48.12 
 
 		 169 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  49.07 
 
 		 169 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  48.68 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  48.75 
 
 		 169 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  48.75 
 
 		 169 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  48.75 
 
 		 169 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  46.84 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 171 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  48.1 
 
 		 168 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  48.72 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 171 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  50 
 
 		 186 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 170 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  46.71 
 
 		 204 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  45.73 
 
 		 169 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  45.51 
 
 		 172 aa  143  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  48.67 
 
 		 167 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  49.34 
 
 		 172 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  52.63 
 
 		 174 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  49.36 
 
 		 173 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  46.91 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  46.71 
 
 		 180 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  46.88 
 
 		 171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.91 
 
 		 169 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  46.15 
 
 		 186 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.37 
 
 		 192 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  44.03 
 
 		 186 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.06 
 
 		 169 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  45.75 
 
 		 180 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.73 
 
 		 192 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  50.65 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  46.98 
 
 		 174 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  50.64 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  43.03 
 
 		 186 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  48.7 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  49.32 
 
 		 172 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.77 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  49.35 
 
 		 173 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  44.81 
 
 		 168 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  43.23 
 
 		 177 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.1 
 
 		 184 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  41.79 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  42.41 
 
 		 161 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 		 173 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 182 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.17 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.74 
 
 		 190 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  43.04 
 
 		 170 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  43.4 
 
 		 181 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  49.01 
 
 		 175 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  49.01 
 
 		 191 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  49.01 
 
 		 191 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 		 161 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.76 
 
 		 160 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 170 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.72 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 		 158 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  37.8 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  45.89 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  47.13 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  39.38 
 
 		 172 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  47.13 
 
 		 166 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  46.1 
 
 		 182 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  48.51 
 
 		 172 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  42 
 
 		 155 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 		 156 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 		 156 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>