More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6010 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  94.86 
 
 
175 aa  339  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  86.86 
 
 
175 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  84.57 
 
 
175 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  84.57 
 
 
175 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  84.57 
 
 
175 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  61.45 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  54.84 
 
 
322 aa  170  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  54.12 
 
 
172 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  54.12 
 
 
172 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  49.08 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  46.39 
 
 
309 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  46.78 
 
 
313 aa  157  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  49.67 
 
 
304 aa  157  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  47.2 
 
 
169 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
169 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
169 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.67 
 
 
166 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  47.27 
 
 
172 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  45.68 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  45.68 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.01 
 
 
169 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
171 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 
169 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 
174 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  48.39 
 
 
170 aa  147  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.3 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  48.78 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  47.33 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  47.13 
 
 
180 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  46.3 
 
 
172 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  54.05 
 
 
172 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 
186 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  44.85 
 
 
174 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.18 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  45.18 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  46.5 
 
 
180 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.07 
 
 
311 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  43.67 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.39 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  43.75 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.78 
 
 
192 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  43.83 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  46.11 
 
 
204 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  46.06 
 
 
170 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.06 
 
 
330 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  46.15 
 
 
327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  44.51 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  44.59 
 
 
167 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 
311 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.37 
 
 
184 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  46.05 
 
 
226 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.16 
 
 
191 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  44.85 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.08 
 
 
311 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
226 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
226 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 
186 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  43.21 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
302 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  39.24 
 
 
182 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.11 
 
 
311 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.36 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.67 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.86 
 
 
306 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  40.38 
 
 
172 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  38.18 
 
 
172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
160 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.49 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  43.23 
 
 
177 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  41.03 
 
 
156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
170 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 
311 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40.65 
 
 
408 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  39.87 
 
 
161 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
156 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  46.53 
 
 
166 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.27 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.24 
 
 
183 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  44.58 
 
 
323 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  38.89 
 
 
188 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.14 
 
 
165 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  43.12 
 
 
318 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  46.3 
 
 
346 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  43.14 
 
 
214 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 
172 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  40.26 
 
 
158 aa  104  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  38.75 
 
 
162 aa  104  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 
161 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>