More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4187 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  94.87 
 
 
156 aa  309  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  61.44 
 
 
155 aa  194  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
393 aa  157  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  49.03 
 
 
158 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  47.1 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.1 
 
 
160 aa  137  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  42.48 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.94 
 
 
311 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.86 
 
 
170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.62 
 
 
177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.38 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  38.85 
 
 
181 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  43.45 
 
 
173 aa  123  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
188 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 
311 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.46 
 
 
259 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.18 
 
 
204 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
160 aa  123  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
188 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.76 
 
 
186 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  42.41 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  40.26 
 
 
188 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.31 
 
 
169 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
169 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  43.31 
 
 
169 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 
169 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  38.22 
 
 
181 aa  121  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  39.87 
 
 
187 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  44.06 
 
 
186 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.75 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.4 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.96 
 
 
174 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
175 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.65 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  42.76 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.74 
 
 
190 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.76 
 
 
165 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  40.76 
 
 
174 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  42.04 
 
 
169 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.61 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  40.4 
 
 
306 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 
226 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  41.4 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  41.4 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  40.67 
 
 
226 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.45 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.58 
 
 
408 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  46.09 
 
 
172 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  43.05 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  41.03 
 
 
175 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.77 
 
 
157 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.25 
 
 
192 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.25 
 
 
192 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.07 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
171 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4010  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.18 
 
 
176 aa  113  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  39.19 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.96 
 
 
190 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 
309 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.46 
 
 
155 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.07 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40.26 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  41.61 
 
 
172 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  35.57 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  39.07 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 
172 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 
327 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.07 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  39.07 
 
 
180 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 
172 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
169 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  40.91 
 
 
191 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  39.33 
 
 
226 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  41.03 
 
 
175 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  42.21 
 
 
164 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
191 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  40.14 
 
 
174 aa  111  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  38 
 
 
161 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.75 
 
 
174 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
304 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.09 
 
 
311 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
161 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.77 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>