More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1964 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  99.41 
 
 		 169 aa  347  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  95.27 
 
 		 169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  95.27 
 
 		 169 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  92.31 
 
 		 169 aa  324  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  83.23 
 
 		 171 aa  289  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  82.25 
 
 		 174 aa  288  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  83.23 
 
 		 171 aa  286  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  79.88 
 
 		 169 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  79.29 
 
 		 169 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  64.2 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  63.95 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  65.29 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.71 
 
 		 192 aa  220  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.48 
 
 		 192 aa  220  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  56.89 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  58.08 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.83 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.68 
 
 		 169 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  57.23 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  54.44 
 
 		 172 aa  188  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  56.63 
 
 		 173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  57.67 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  55.42 
 
 		 186 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  57.83 
 
 		 173 aa  180  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  55.13 
 
 		 175 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  52.15 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  48.77 
 
 		 322 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  45.96 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  45.68 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.08 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.75 
 
 		 309 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  47.8 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  48.73 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  42.86 
 
 		 313 aa  144  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  43.9 
 
 		 304 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  47.13 
 
 		 174 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  46.91 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  51.52 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.58 
 
 		 311 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  45.18 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  46.25 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  50.75 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  48.37 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  48.37 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  43.75 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  43.75 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  39.88 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  52 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  47.71 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  50 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  41.61 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  41.61 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.17 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  43.95 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  43.67 
 
 		 408 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.23 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.52 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  47.26 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.15 
 
 		 330 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  41.14 
 
 		 202 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  39.05 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  40.26 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  43.23 
 
 		 207 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 		 327 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  38.12 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  42.24 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  47.71 
 
 		 182 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.51 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.61 
 
 		 311 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 		 162 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  45.33 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  46.3 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  40.15 
 
 		 302 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  41.35 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  41.35 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  41.35 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  43.07 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 		 311 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  37.91 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>