More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3360 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 172 aa  355  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  57.53 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  56.33 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  56.33 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  48.19 
 
 		 177 aa  147  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  45.62 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 		 322 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  47.31 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1491  flavin reductase-like, FMN-binding  44.24 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  47.01 
 
 		 313 aa  124  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  44.67 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  42.26 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.51 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  46.2 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  45.7 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  44.08 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  45.39 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  41.5 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  44.03 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  44.74 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  43.4 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  46.58 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.67 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  43.26 
 
 		 304 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.42 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.51 
 
 		 309 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  45.33 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.62 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  43.04 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  45.33 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  45.33 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  45.33 
 
 		 169 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  47.06 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.74 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.08 
 
 		 192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  42.48 
 
 		 408 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  43.87 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.47 
 
 		 311 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  40.76 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  41.51 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  43.31 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  39.29 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  45.27 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  45.04 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  44.24 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  44.24 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  42.68 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  40.13 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  34.01 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  42.57 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  38.69 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.75 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  43.17 
 
 		 311 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  40.8 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  39.1 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.18 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 		 311 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.18 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  43.18 
 
 		 311 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  42.11 
 
 		 306 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.48 
 
 		 311 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  42 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  34.39 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.13 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  39.87 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.78 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1695  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.42 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  41.78 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  41.78 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.68 
 
 		 302 aa  95.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 393 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 226 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>