More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1986 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1986  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  345  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1695  flavin reductase domain protein FMN-binding  79.27 
 
 
166 aa  285  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
171 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
174 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  41.14 
 
 
169 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
169 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
169 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 
173 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 
169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  39.87 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 
169 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
169 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.62 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.82 
 
 
186 aa  117  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
186 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  38.26 
 
 
180 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
322 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  35.81 
 
 
186 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  36.91 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  39.38 
 
 
204 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
190 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.12 
 
 
168 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  37.65 
 
 
186 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
168 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 
311 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  38.12 
 
 
191 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  38 
 
 
172 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
170 aa  104  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 
192 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  37.86 
 
 
166 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.88 
 
 
192 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  33.33 
 
 
313 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.53 
 
 
169 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
172 aa  101  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.08 
 
 
191 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
166 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 
175 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  35.53 
 
 
186 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
156 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
173 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  34.01 
 
 
309 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  35.29 
 
 
177 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  36.18 
 
 
172 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  30.77 
 
 
408 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  33.77 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  37.75 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
304 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 
161 aa  98.6  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.97 
 
 
179 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  33.99 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 
191 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  32.68 
 
 
191 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.89 
 
 
171 aa  97.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 
156 aa  97.1  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  34.9 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  34.73 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.76 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
393 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.55 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  36.96 
 
 
311 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.68 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.69 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  32.1 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  30.57 
 
 
163 aa  94.7  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  36.11 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  33.75 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  30.38 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  31.61 
 
 
187 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
164 aa  92  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  34.19 
 
 
193 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
181 aa  91.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  35.42 
 
 
175 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  31.25 
 
 
204 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
188 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
188 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
172 aa  90.9  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  36.11 
 
 
172 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  29.87 
 
 
327 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  29.53 
 
 
182 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  31.33 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.49 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  36.05 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  30.87 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  28.93 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>