More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3603 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  100 
 
 
172 aa  350  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  53.59 
 
 
180 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.78 
 
 
311 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  50.98 
 
 
180 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  47.8 
 
 
186 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  46.45 
 
 
322 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  47.06 
 
 
304 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.7 
 
 
309 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  47.06 
 
 
313 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  46.67 
 
 
186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  48 
 
 
173 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  47.97 
 
 
168 aa  130  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  43.11 
 
 
172 aa  130  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.67 
 
 
186 aa  130  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  45.33 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  44.67 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  43.51 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.28 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  43.31 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
172 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  45.89 
 
 
171 aa  124  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  51.33 
 
 
172 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  43.12 
 
 
186 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  43.03 
 
 
171 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  43.87 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  43.92 
 
 
172 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.33 
 
 
166 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
182 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  45.39 
 
 
311 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 
171 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  44.67 
 
 
173 aa  120  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
169 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
169 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
175 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  44.38 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  44.38 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  44.38 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.77 
 
 
311 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
327 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.79 
 
 
169 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  44.38 
 
 
175 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  46.1 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  46.1 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.11 
 
 
311 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
311 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  40.72 
 
 
408 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  42.59 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.48 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  43.67 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  43.27 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  41.03 
 
 
306 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  41.92 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 
393 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
226 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  38.16 
 
 
226 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.87 
 
 
184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.06 
 
 
191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  39.39 
 
 
191 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  39.39 
 
 
191 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  41.29 
 
 
177 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  36.18 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.83 
 
 
192 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.83 
 
 
192 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  39.88 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  40.26 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  48.03 
 
 
320 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.33 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.92 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.21 
 
 
171 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  39.47 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  45.39 
 
 
318 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.52 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 
170 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  38.18 
 
 
182 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  40.48 
 
 
178 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.33 
 
 
177 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  41.88 
 
 
168 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  40.25 
 
 
168 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  38.31 
 
 
204 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
188 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
188 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  37.91 
 
 
202 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
302 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>