More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6086 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  100 
 
 		 306 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  63.84 
 
 		 311 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.17 
 
 		 311 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  65.15 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  58.56 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  58.56 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  57.66 
 
 		 226 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  44.73 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  40.47 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.4 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  40.94 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  41.8 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  40.89 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  38.02 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  40.39 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  51.66 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  48.72 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  45.3 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  41.9 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.04 
 
 		 188 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.45 
 
 		 190 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  45.22 
 
 		 166 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 		 180 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 		 170 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 182 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  42.77 
 
 		 188 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 		 188 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  40.25 
 
 		 188 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  39.62 
 
 		 204 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  41.21 
 
 		 174 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  44.37 
 
 		 172 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  41.56 
 
 		 180 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  39.1 
 
 		 187 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  43.14 
 
 		 207 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.86 
 
 		 171 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 169 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  45.7 
 
 		 172 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  45.7 
 
 		 172 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.91 
 
 		 183 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 193 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  48.65 
 
 		 172 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.11 
 
 		 190 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  38.36 
 
 		 169 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.45 
 
 		 179 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  42.29 
 
 		 175 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 		 161 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 		 161 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  38.99 
 
 		 188 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.52 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40.4 
 
 		 175 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  39.26 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  37.66 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  39.26 
 
 		 161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  42.76 
 
 		 186 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  40.4 
 
 		 156 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  40.4 
 
 		 156 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  42.95 
 
 		 172 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  41.03 
 
 		 172 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  41.86 
 
 		 175 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  39.74 
 
 		 161 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  38.31 
 
 		 171 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  40.4 
 
 		 170 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.65 
 
 		 186 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 		 186 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 167 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  44.12 
 
 		 174 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.28 
 
 		 166 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  42.58 
 
 		 171 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  44.78 
 
 		 171 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.36 
 
 		 165 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  42.54 
 
 		 173 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.93 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 161 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  37.78 
 
 		 161 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  41.51 
 
 		 164 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  41.86 
 
 		 168 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  43.51 
 
 		 186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  46.67 
 
 		 181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  46.92 
 
 		 177 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  38 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.16 
 
 		 170 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  43.84 
 
 		 175 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  44.29 
 
 		 175 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  44.96 
 
 		 172 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  43.84 
 
 		 175 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  43.84 
 
 		 175 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  43.28 
 
 		 169 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  43.28 
 
 		 169 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  43.28 
 
 		 169 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>