More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6253 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  70.68 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  72.4 
 
 		 311 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  63.84 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  68.92 
 
 		 226 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  68.92 
 
 		 226 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  65.93 
 
 		 226 aa  301  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  41.14 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  37.42 
 
 		 327 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.42 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  38.74 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  47.54 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  36.1 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  47.44 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  46.36 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  36.16 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  46.98 
 
 		 170 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  49.67 
 
 		 408 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.12 
 
 		 190 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  47.77 
 
 		 166 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.37 
 
 		 171 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  45.57 
 
 		 172 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  45.57 
 
 		 172 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  46.05 
 
 		 182 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  43.71 
 
 		 180 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.38 
 
 		 188 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.44 
 
 		 190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  45.03 
 
 		 180 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  42.67 
 
 		 156 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  44.74 
 
 		 172 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.31 
 
 		 186 aa  126  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  44.59 
 
 		 186 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 188 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  43.71 
 
 		 186 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 188 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  44.16 
 
 		 173 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  41.33 
 
 		 156 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  39.16 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  41.45 
 
 		 179 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  43.33 
 
 		 174 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 		 167 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  38.36 
 
 		 187 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  37.74 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  44.85 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.29 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  41.56 
 
 		 171 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 175 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  45.59 
 
 		 168 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  38.36 
 
 		 169 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  42.11 
 
 		 161 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  47.3 
 
 		 172 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  40.38 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  43.51 
 
 		 172 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.65 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.29 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 		 169 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 		 169 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 		 193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.26 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  42.21 
 
 		 172 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  45.11 
 
 		 186 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  42.21 
 
 		 175 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4310  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.61 
 
 		 203 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.18 
 
 		 165 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.22 
 
 		 191 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  36.81 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  43.75 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  44.36 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  45.11 
 
 		 171 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  41.56 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  43.61 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  43.61 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 		 175 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.61 
 
 		 174 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.82 
 
 		 155 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  43.61 
 
 		 169 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 169 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 		 169 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 		 175 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 		 175 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 169 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 		 175 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 		 169 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  43.57 
 
 		 175 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  42.36 
 
 		 178 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.61 
 
 		 184 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  48.15 
 
 		 173 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  45.38 
 
 		 177 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  43.57 
 
 		 191 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  43.57 
 
 		 191 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>