More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3842 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  55.74 
 
 
188 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  55.74 
 
 
204 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  55.74 
 
 
188 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  54.35 
 
 
188 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  54.35 
 
 
188 aa  203  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  52.91 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  57.63 
 
 
190 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  52.91 
 
 
188 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2668  flavin reductase domain-containing protein  52.11 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179398  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  51.58 
 
 
185 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  52.94 
 
 
204 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  50.67 
 
 
179 aa  158  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  50 
 
 
191 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50.33 
 
 
171 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.99 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  50 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.36 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  46.05 
 
 
393 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  47.37 
 
 
172 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  45.33 
 
 
168 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  48.41 
 
 
191 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  47.33 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  42.48 
 
 
169 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  45.62 
 
 
162 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  40.62 
 
 
182 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 
175 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.91 
 
 
330 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.37 
 
 
165 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  43.79 
 
 
169 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  43.14 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  42.48 
 
 
193 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  44.44 
 
 
311 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  39.62 
 
 
202 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.72 
 
 
311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.64 
 
 
404 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  43.62 
 
 
408 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  44.03 
 
 
327 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.9 
 
 
311 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
161 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  42.48 
 
 
160 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
161 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  40.79 
 
 
161 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.48 
 
 
311 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  39.87 
 
 
311 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  42.11 
 
 
306 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3451  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
161 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.299495  normal  0.309521 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  42.41 
 
 
172 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  41.94 
 
 
161 aa  121  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  42.41 
 
 
172 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  41.45 
 
 
161 aa  120  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  40.13 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  40.13 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.11 
 
 
162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  40.79 
 
 
161 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  41.67 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2256  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
161 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550172  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  40.51 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  39.47 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
304 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  41.5 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3234  flavin reductase-like, FMN-binding  38.16 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.15 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  36.31 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  45.28 
 
 
323 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
177 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.18 
 
 
168 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
302 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.31 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  41.29 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  43.23 
 
 
320 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  38.71 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  40.12 
 
 
318 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  36.84 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.54 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  42.18 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  42.18 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  38.85 
 
 
177 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
226 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.71 
 
 
170 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 
226 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.82 
 
 
170 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.41 
 
 
174 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  35.81 
 
 
172 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.13 
 
 
169 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.07 
 
 
160 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  34.87 
 
 
172 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
167 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  38.71 
 
 
181 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  39.47 
 
 
186 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2676  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.36 
 
 
204 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.80645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>