More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1491 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1491  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 166 aa  342  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  45.68 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  46.95 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  44.24 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  48.28 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  49.69 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  49.69 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  40 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.04 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  40.38 
 
 		 313 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  40.79 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.54 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  42.04 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.66 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  41.4 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  39.24 
 
 		 322 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  38.82 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  41.1 
 
 		 408 aa  103  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.16 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.1 
 
 		 311 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  40.79 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  33.54 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  37.16 
 
 		 182 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  37.01 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.71 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  36.84 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  39.22 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  40.13 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  36 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  41.45 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.1 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.5 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  42.11 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  37.18 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 309 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  35.81 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  39.6 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.52 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  40.13 
 
 		 207 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.67 
 
 		 311 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  39.35 
 
 		 430 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 188 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 188 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  41.92 
 
 		 318 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  37.89 
 
 		 181 aa  94  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  39.35 
 
 		 214 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.35 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 		 311 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  32.43 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 302 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  39.84 
 
 		 311 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  38.56 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  37.82 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.94 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.71 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.31 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  34.01 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  36.91 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 170 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  38 
 
 		 311 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  37.01 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  34.19 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  37.65 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 		 393 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.59 
 
 		 330 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.94 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  37.33 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 226 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 226 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 		 304 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 226 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  39.62 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  39.62 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>