More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2124 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  44.3 
 
 
156 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.14 
 
 
155 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  41.61 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
160 aa  114  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  42.24 
 
 
157 aa  114  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  44.52 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.68 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
158 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.4 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.94 
 
 
311 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.71 
 
 
178 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.84 
 
 
165 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.75 
 
 
430 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0515  flavin reductase-like, FMN-binding  36.67 
 
 
160 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.2 
 
 
169 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  37.58 
 
 
202 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.11 
 
 
177 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.91 
 
 
169 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  34.88 
 
 
169 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
309 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  33.33 
 
 
181 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.4 
 
 
179 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  38.24 
 
 
175 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.42 
 
 
159 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  38.56 
 
 
172 aa  101  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.91 
 
 
171 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  34.32 
 
 
169 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
181 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  33.77 
 
 
313 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  38.67 
 
 
172 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  38.67 
 
 
172 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  42 
 
 
168 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.36 
 
 
168 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  35.85 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  34.91 
 
 
169 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
304 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  36.54 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.44 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  42.03 
 
 
166 aa  98.6  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  38 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  42.31 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  38 
 
 
186 aa  98.6  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  37.09 
 
 
393 aa  98.2  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  35.17 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
175 aa  97.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  34.87 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0442  putative flavin reductase  34.31 
 
 
164 aa  97.4  9e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.77 
 
 
155 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  36.08 
 
 
168 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  34.32 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  38.69 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.47 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.8 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  31.61 
 
 
163 aa  96.7  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  35.48 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  38.69 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  41.3 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  35.53 
 
 
322 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  33.99 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.6 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.36 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  38.69 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.34 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.06 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  38.1 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  45.53 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3185  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
175 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  41.54 
 
 
172 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
167 aa  94.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  33.77 
 
 
161 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  36.42 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.94 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  35.44 
 
 
191 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
161 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
174 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
161 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  41.94 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
181 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.96 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  40.91 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  35.33 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.87 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>