More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4436 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4436  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  357  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4507  flavin reductase-like, FMN-binding  46.71 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.657354  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  42.95 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  41.89 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.86 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  40.91 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.82 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  42.18 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.28 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4057  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  40.65 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 		 186 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.14 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  40.52 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  37.11 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.22 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  34.9 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.34 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  37.01 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.67 
 
 		 135 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0871  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.67 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5008  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  39.04 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.67 
 
 		 330 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  39.04 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.18 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.4 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.82 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  36.67 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0355  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0401487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.76 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0895  flavin reductase family protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1057  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.667997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0898  flavin reductase family protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0264693  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2488  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.276719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0653  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0962723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0101  flavin reductase domain-containing protein  38.51 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  36.91 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.04 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  38.52 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.35 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.59 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  37.5 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2570  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.49 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2645  flavin reductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2616  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.19 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2660  flavin reductase domain-containing protein  35.19 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0383927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0763  putative monooxygenase oxidoreductase protein  37.58 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.205709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1836  hypothetical protein  33.77 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0567658  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  37.04 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 		 322 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  33.33 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  36.88 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  37.88 
 
 		 313 aa  81.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  35.56 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  37.93 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  35.06 
 
 		 302 aa  81.3  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  32.91 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.97 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  38.46 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2755  flavin reductase domain protein  36.54 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0570474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.64 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  36.26 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.14 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.89 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 		 327 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.95 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.95 
 
 		 191 aa  77.4  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0811  flavin reductase-like, FMN-binding  33.72 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2179  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.14 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1934  flavin reductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.07 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.31 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>