More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0868 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0868  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
237 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.240136  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  62.72 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.06 
 
 
170 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  44.12 
 
 
181 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.2 
 
 
174 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  42.35 
 
 
181 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.77 
 
 
155 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.25 
 
 
183 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  36.47 
 
 
156 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  39.56 
 
 
322 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.76 
 
 
166 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.37 
 
 
168 aa  99  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  34.12 
 
 
156 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  34.5 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  36.47 
 
 
161 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  39.08 
 
 
178 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  33.91 
 
 
160 aa  95.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  37.79 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.64 
 
 
311 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  38.6 
 
 
309 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.3 
 
 
179 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  34.3 
 
 
158 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1554  flavin reductase domain-containing protein  35.88 
 
 
154 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149656  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0693  flavin reductase domain-containing protein  32.94 
 
 
174 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.84 
 
 
177 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  33.92 
 
 
188 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  36.36 
 
 
174 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.54 
 
 
179 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  42.33 
 
 
166 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  39.78 
 
 
175 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  35 
 
 
162 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.62 
 
 
163 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  38.46 
 
 
175 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  35.09 
 
 
169 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3318  flavin reductase-like, FMN-binding  37.57 
 
 
170 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000349305  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
170 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1723  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.18 
 
 
196 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.88 
 
 
155 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  39.78 
 
 
175 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
170 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.53 
 
 
184 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  39.78 
 
 
175 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5305  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.29 
 
 
184 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  37.21 
 
 
168 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.97 
 
 
135 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
175 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  38.01 
 
 
175 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  33.93 
 
 
169 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  37.57 
 
 
175 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  41.76 
 
 
173 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  36.11 
 
 
408 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0087  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.5 
 
 
186 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  36.99 
 
 
313 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2689  flavin reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
181 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  37.06 
 
 
172 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  37.06 
 
 
172 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  30.59 
 
 
161 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  40.14 
 
 
172 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  32 
 
 
166 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3360  flavin reductase-like, FMN-binding  35.29 
 
 
172 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.439324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  38.32 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.43 
 
 
165 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2759  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.05 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0065  flavin reductase-like, FMN-binding  33.92 
 
 
166 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.99238e-16  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2876  flavin reductase domain-containing protein  37.14 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0713  flavin reductase domain-containing protein  36.02 
 
 
171 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  37.28 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  35.5 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  33.51 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  36.05 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4664  flavin reductase-like, FMN-binding  34.5 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3699  flavin reductase domain-containing protein  34.5 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.927223  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  32.37 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0068  flavin reductase domain-containing protein  34.91 
 
 
186 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1265  flavin reductase domain-containing protein  41.52 
 
 
166 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.463145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  35.63 
 
 
186 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2607  nitrilotriacetate monooxygenase component B  41.52 
 
 
166 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.396427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.64 
 
 
192 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.73 
 
 
170 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2411  flavin reductase-like, FMN-binding  33.92 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  30.99 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  35.26 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.9 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.42 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  30.99 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.16 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0779  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.11 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0273259  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  34.92 
 
 
186 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  34.5 
 
 
175 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.99 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.16 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  32.96 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.43 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  34.1 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3405  flavin reductase-like, FMN-binding  34.13 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>