More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0953 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.3 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.87 
 
 
174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.45 
 
 
155 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  39.74 
 
 
156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  39.61 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32170  Flavin reductase domain protein  38.29 
 
 
313 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.14 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1186  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.74 
 
 
164 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  39.1 
 
 
156 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.56 
 
 
155 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 
162 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
160 aa  105  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.82 
 
 
165 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  40.36 
 
 
309 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.44 
 
 
177 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.94 
 
 
159 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  40.51 
 
 
178 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
393 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
173 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.71 
 
 
160 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2676  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.51 
 
 
204 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  35.9 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6362  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.58 
 
 
157 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5488  flavin reductase-like, FMN-binding  43.51 
 
 
175 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6774  flavin reductase domain-containing protein  43.51 
 
 
175 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  43.07 
 
 
173 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  36.46 
 
 
327 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4700  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.44 
 
 
179 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.403241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1795  flavin reductase domain-containing protein  41.18 
 
 
164 aa  98.2  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.629541  normal  0.120123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  36.18 
 
 
185 aa  98.2  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  39.22 
 
 
304 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.46 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.69 
 
 
171 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  38.15 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 
163 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.52 
 
 
430 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7180  flavin reductase-like, FMN-binding  42.86 
 
 
175 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.050322 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  40.52 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  35.93 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1345  flavin reductase-like, FMN-binding  37.87 
 
 
174 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000569792  hitchhiker  0.00000938161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2574  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
181 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  32.45 
 
 
166 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3861  flavin reductase-like, FMN-binding  36.81 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657973  normal  0.52723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  37.58 
 
 
408 aa  95.1  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.22 
 
 
311 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3558  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.74 
 
 
182 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  36.48 
 
 
172 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
172 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  38.61 
 
 
311 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  39.55 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2409  flavin reductase domain-containing protein  36.88 
 
 
181 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  37.58 
 
 
161 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  35.53 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  37.27 
 
 
172 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
311 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6010  flavin reductase domain-containing protein  41.94 
 
 
175 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4835  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 
186 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.18 
 
 
162 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.42 
 
 
166 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.71 
 
 
179 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2119  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
322 aa  92  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.6 
 
 
311 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6306  flavin reductase domain-containing protein  41.29 
 
 
175 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.357776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.76 
 
 
168 aa  91.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.9 
 
 
161 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  37.74 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  33.54 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.44 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0221  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.67 
 
 
135 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  35.9 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  30.06 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2957  flavin reductase-like, FMN-binding  38.16 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0378  flavin reductase domain-containing protein  38.61 
 
 
168 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  39.35 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  41.67 
 
 
168 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3440  flavin reductase domain-containing protein  36.91 
 
 
161 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540454  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.71 
 
 
165 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1792  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
175 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  35.88 
 
 
204 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2083  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 
161 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
186 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  38.04 
 
 
169 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  32.34 
 
 
174 aa  88.2  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.58 
 
 
191 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0580  flavin reductase-like  33.12 
 
 
163 aa  88.2  8e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  32.93 
 
 
167 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
169 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
169 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  37.91 
 
 
306 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  35.22 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.22 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.36 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>