More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5477 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  50.91 
 
 
190 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  55.62 
 
 
186 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  47.4 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  50.62 
 
 
191 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  49.34 
 
 
193 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  47.24 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.08 
 
 
189 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  46 
 
 
179 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.67 
 
 
179 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  46.39 
 
 
173 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 
190 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  54.68 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  37.24 
 
 
166 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.42 
 
 
164 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  33.55 
 
 
154 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.77 
 
 
164 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  35.54 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.3 
 
 
408 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 
164 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3017  nitrilotriacetate monooxygenase  36.08 
 
 
172 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3743  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
172 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  38.64 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  32.72 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  33.97 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.96 
 
 
374 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 
181 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  29.75 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 
169 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  32.21 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  33.53 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  32.21 
 
 
210 aa  92  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
162 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  30.38 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  30.81 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  31.29 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.21 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.9 
 
 
190 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  36.43 
 
 
318 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.18 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.17 
 
 
170 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  30.32 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  37.12 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3537  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.9 
 
 
404 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.48 
 
 
171 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.72 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.67 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.45 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
169 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.36 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  36.15 
 
 
179 aa  87.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
155 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.25 
 
 
184 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  35.22 
 
 
170 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  33.95 
 
 
306 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.21 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  32.65 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  32.08 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  32.08 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.77 
 
 
190 aa  84.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
160 aa  84.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1186  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.03 
 
 
164 aa  84.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  36.96 
 
 
150 aa  84.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  29.01 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  31.25 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  32.3 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0953  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.9 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.81 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  31.45 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.44 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  32.73 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  34.11 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.2 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  29.48 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  35.86 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2261  flavin reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  32 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
203 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1916  flavin reductase domain-containing protein  31.91 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.751349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  34.13 
 
 
172 aa  82  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  27.16 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.33 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  32.41 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  35.88 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
393 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>