More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7128 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  100 
 
 		 167 aa  341  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  47.2 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  46.2 
 
 		 183 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.72 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  41.46 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  44.22 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  41.56 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  40.96 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  41.56 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  37.42 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  35.48 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  37.42 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  35.58 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.49 
 
 		 374 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.77 
 
 		 202 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  38.82 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  37.58 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.08 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  37.89 
 
 		 178 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  36.77 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.47 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.42 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  37.16 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.31 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  38.93 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  42.86 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.44 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  34.9 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.95 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  36.54 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.18 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  37.01 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  40 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  37.41 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  35.37 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  38.93 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  34.18 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  34.81 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  34.18 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  36.18 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  39.47 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.81 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 		 204 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.24 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  37.91 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.54 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  34.42 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 196 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  34.42 
 
 		 210 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  33.54 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.03 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  33.54 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.8 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.24 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  33.54 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  31.85 
 
 		 186 aa  94.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  34.42 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  31.65 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  31.65 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  31.65 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  32.26 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  31.65 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  31.65 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  35.57 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  31.61 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.36 
 
 		 330 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1133  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.52 
 
 		 170 aa  90.9  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.12 
 
 		 186 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  30.46 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  35.38 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 393 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  37.74 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>