More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3957 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  100 
 
 
175 aa  353  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  47.55 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
170 aa  132  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.04 
 
 
204 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  40 
 
 
171 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  40.24 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  42.94 
 
 
173 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.18 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  42.26 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  41.46 
 
 
167 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.04 
 
 
180 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
185 aa  121  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  42.24 
 
 
178 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.75 
 
 
201 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  44.16 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.73 
 
 
374 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.99 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.75 
 
 
202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  40.26 
 
 
162 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  41.25 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
184 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 
175 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.26 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  41.46 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  39.61 
 
 
180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.04 
 
 
181 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.46 
 
 
172 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  38.46 
 
 
193 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  38.46 
 
 
193 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  37.82 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  37.28 
 
 
168 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2423  flavoprotein oxidoreductase  43.62 
 
 
150 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.284229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  37.8 
 
 
183 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  40.61 
 
 
180 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  38 
 
 
168 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.5 
 
 
164 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  36.65 
 
 
430 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  38.12 
 
 
169 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  37.34 
 
 
176 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  37.5 
 
 
164 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  37.5 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  37.5 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  41.5 
 
 
226 aa  104  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  37.5 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  37.5 
 
 
164 aa  104  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  39.13 
 
 
173 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  38.13 
 
 
166 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  43.8 
 
 
173 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  39.13 
 
 
210 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  38.55 
 
 
165 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 
165 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  40 
 
 
172 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.24 
 
 
170 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.13 
 
 
164 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 
203 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 
226 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 
226 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 
226 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  38.79 
 
 
179 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  38.41 
 
 
174 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  41.83 
 
 
226 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.13 
 
 
186 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  35.95 
 
 
170 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  37.34 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.76 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
185 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  39.35 
 
 
174 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
228 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.75 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  40.82 
 
 
228 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  37.35 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.86 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.31 
 
 
330 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  38.55 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  38.55 
 
 
181 aa  97.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  36.08 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  41.01 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.01 
 
 
177 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  40.37 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.69 
 
 
165 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  38.64 
 
 
147 aa  94.7  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.25 
 
 
170 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.13 
 
 
168 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  36.69 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.2 
 
 
181 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  37.2 
 
 
181 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.85 
 
 
170 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  36.59 
 
 
216 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.33 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  35.22 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  32.08 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  38.96 
 
 
170 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  36.08 
 
 
408 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  28.4 
 
 
188 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
156 aa  91.7  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>